在17世紀日本江戶幕府的禁教時代, 兩名天主教神父(安德魯加菲爾和亞當崔佛 飾)偷渡到日本調查恩師(連恩尼遜 飾)受迫害宣誓棄教之謎, 在潛藏日本的過程中, 目睹了各種凌遲與磨難, 兩人開始懷疑自己一直堅持的初衷, 更被迫面臨最艱難的抉擇...