一名頂尖偵探哈利古德曼突然失踪,
他的兒子提姆與哈利的前寶可夢搭檔皮卡丘一起尋找哈利,
在萊姆市設法解開一個又一個複雜謎團,
也將揭露一樁極有可能摧毀寶可夢與人類和平共存現狀的陰謀,
甚至可能摧毀整個寶可夢宇宙…。